Γειά σου, όπως το περιγράφεις έχεις αποχωμάτωση του π.χ. πέραν των 0,70μ η οποία θα δηλωθεί ως λοιπή παράβαση. Τι ενοείς ότι το ισόγειο "σκάφτηκε πιο βαθιά"; Eλέγχεις τα εσωτερικά ύψη και αν προκύπτουν μεγαλύτερα απο της αδείας χρεώνεις αντίστοιχα ΥΥ.
Προσωπικά συμφωνώ με την ΥΔ + ΥΚ για το υπόγειο, για το ισόγειο αν ο χώρος δεν είναι προσβάσιμος και είναι μπαζωμένος τότε το βάζεις και αυτον μέσα στην ΛΠ, εκτός αν οπτικά δείχνει ότι θα γίνει μαμουνιά στο μέλλον και θα ανοίξει οπότε ΥΔ ως είπες αρχικά.
Τα διαφορετικά εξωτερικά κουφώματα είναι κατ.3 αλλά μπορείς να τα ενσωματώσεις στην ΛΠ μαζί με την αποχωμάτωση και το μπάζωμα. Δεν υπάρχει κάποια σχέση με τα δ.ε. που αναφέρεις επιμετρείς χοντρικά τις ποσότητες, υπάρχει αντίστοιχος πίνακας στο Πάραρτημα του Ν.4495/17, το να μπαίνεις σε τόση λεπτομέρεια στην επιμέτρηση των κουφωμάτων είναι ανούσιο.